化粪池作业危险首要来自于空气不流通的密闭空间，被比严峻的气体（如二氧化碳）抢占，氧气含量低，施工人员进入后，可由于缺氧而窒息。当密闭空间存在的甲烷或沼气等易燃气体，或在其内进行涂漆、喷漆、运用易燃易爆溶剂等，如遇焊接、切开等作业产生的火花时，可能导致火灾乃至爆炸。
        对进入化粪池作业的人员应上岗练习，了解池内可存在的有毒气体及防护常识。作业前应先测定化粪池内是否存在有毒气体，且氧浓度、有毒有害气体浓度是否都契合安全标准。（一般可以选用便携式气体检测仪测量）
        若初度检测浓度超支，应对池内进行充分通风，直到确保作业人员能安全进行作业。进入化粪池作业人员有必要戴好防毒面具、防化服及安全带等防护用品，池外一般配2人牵绳保护。若条件不允许，化粪池内无法通风，则有必要穿戴全封闭防化服协作空气呼吸器等防护。企业装备有必要的救援器件，如呼吸器、安全梯、安全绳以及其他必要医药应急包等。一般作业时化粪池外有人要协作，首要是用于协作池内作业人员，一旦发现紧急情况当即救援。